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バイオステーションポッドキャスト 
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By Biostation

「生命科学を、もっと身近に」

バイオステーションは、最新の生命科学研究を分かりやすくお伝えすることを目指します。
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#1 Fireside Chat with a postdoc podcaster (Guest: Dr. Takeyuki Miyawaki)

バイオステーションポッドキャスト Bio-station PodcastFeb 22, 2022

00:00
01:34:08
#12 Translating the allure of translation (ゲスト:岩崎信太郎さん(理研))
Apr 02, 202401:14:03
#11 Chance favors the prepared mind (ゲスト:石黒啓一郎さん(熊本大))
Feb 28, 202401:18:16
#10 Tethering Ideas to Technologies (ゲスト:平林祐介さん(東大/工))

#10 Tethering Ideas to Technologies (ゲスト:平林祐介さん(東大/工))

東大工学部で准教授として研究室を主宰されています平林祐介さんをゲストにお呼びしました。これまで平林さんが成果をあげられてきた神経幹細胞のクロマチンによる運命制御機構の解明やオルガネラ相互作用の研究について、留学事情や日本での独立事情などキャリアについてのトピックも交えてお話ししました。(収録日2023.11.07)


今回収録時間の関係もあり研究内容の詳細をお話ししていないので、以下を参考にしていただければ幸いです(文責/管理人)。

・最初の仕事(Development, 2004)神経幹細胞研究の黎明期にWntシグナルが神経幹細胞のニューロン分化を促進することを報告。in vitro, in vivoの両方においてWntシグナルの活性化により神経幹細胞からニューロンへの分化が促進する。

・ポリコームの仕事(Neuron, 2009)Wntは発生後期にも活性化しているにも関わらずニューロン分化が起きないメカニズムとして、ヒストン修飾による遺伝子発現の抑制を報告。

・留学先での仕事(Science, 2017)ミトコンドリアと小胞体を繋留するタンパク質としてPDZD8を同定。哺乳類では初のミトコンドリア-小胞体テザリング因子の発見。

・独立して最初の仕事(PLoS Biology, 2023)オルガネラの詳細な観察のため、対話的に深層学習モデルをトレーニングする画像解析プラットフォームを開発。迅速かつ正確な連続切片電顕画像の再構成でミトコンドリアやクリステ構造を3次元再構築。


Shownotes:

平林さんラボHP

後藤研

仲嶋先生(慶応)

古関先生(理研)

佐原さん(King's College London)

Dec 03, 202301:10:19
#9 The More the Merrier (ゲスト/坪山幸太郎さん (東大/生産研))
Sep 08, 202301:08:15
#8 Drive from Egg to Space (ゲスト:明楽隆志さん (NIH))
Aug 14, 202301:35:01
#7 研究は博打?(ゲスト:鯨井智也さん(東大定量研助教))

#7 研究は博打?(ゲスト:鯨井智也さん(東大定量研助教))

東大定量科学研究所(胡桃坂研究室)助教の鯨井智也をゲストにお呼びしました。鯨井さんはクロマチン構造分野で次々に新しい構造を決められており、特にRNAポリメラーゼ2とヌクレオソームを中心とした転写複合体の構造や、自然免疫にかかわるcGASとヌクレオソームの構造などでトップジャーナルにも多くの論文を出されています。今回クロマチン構造解析の歴史やこれまでの研究の裏話などをお聞きしました。(収録日2022.10.21)


Shownotes:

胡桃坂研究室

木村宏先生

Mintobody()

抗体の論文


①H3.Yの話

3.Y=ヒストンバリアントH3.Y (最初説明も忘れた上に、3.1って言っている気がします、すいません。)

鯨井さんの論文 (NAR, 2016Nucleus, 2017)

ヌクレオソームの高分解度構造(1997)

H2A.Zを含むヌクレオソーム構造 (2001)

H3.Tの構造 (2010)

H3.Yは2010年に発見された

CENP-Aの構造

堀越さんがH2A.Z

有村さんがH2A.B


②Pol2の話

鯨井さんの論文(Science, 2018; Science, 2019; Science, 2022)

大川先生

細胞内でヌクレオソームは転写のバリアになっている(Steven Henikoffラボの論文)

関根先生

町田さん(の論文)

Grafix法

SMARCAD1-nucleosomeの構造

Cramerラボと競争になっていた

Seychelle M. Vos


③cGASの話

鯨井さんの論文(Science, 2020)

同時に出た4本の論文(1, 2, 3, 4)

船曳先生

CENP-N

Christian Zierhut (2019年にCellに論文出してる)

GFP-cGASでの局在解析

2019年のeLife

Nicolas Thoma

Mar 23, 202301:23:53
#6 みかん箱で実験!? Part2 (ゲスト:古館昌平さん(ポスドク@Sainsbury Wellcome Centre))
Oct 21, 202201:23:33
#5 みかん箱で実験!? Part1 (ゲスト:古館昌平さん/ポスドク@Sainsbury Wellcome Centre)
Oct 10, 202201:36:52
#4 An unexpected reunion -栄養を分子で理解する- (ゲスト:理研/小幡研究室 小坂元陽奈さん)
Aug 16, 202248:43
#3 アカデミックキャリアは出家と同じ!?(ゲスト:東工大准教授 野澤佳世さん)
Jun 29, 202201:38:40
#2 Reunion with Lemon Sour (Guest: Mr. Masato Inoue)
Apr 02, 202258:57
#1 Fireside Chat with a postdoc podcaster (Guest: Dr. Takeyuki Miyawaki)
Feb 22, 202201:34:08