Jafarilab
By Mohieddin Jafari
JafarilabJun 20, 2020
Episode 26 - Writing a response to reviewers (پاسخ به داوران)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
فصل سوم
قسمت بیستم و ششم:
پاسخ به داوران
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 25 - finding and selecting R packages (جستجو و انتخاب بسته های آر)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
فصل سوم
قسمت بیستم و پنجم:
جستجو و انتخاب بسته های آر
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 24 - Getting published (انتشار مقاله علمی)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
فصل سوم
قسمت بیستم و چهارم:
انتشار مقاله علمی
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 23 - Structuring papers (نوشتن مقاله علمی)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
فصل سوم
قسمت بیستم و سوم:
نوشتن مقاله علمی
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 22 - Choosing a PhD supervisor (انتخاب استاد راهنما)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
فصل سوم
قسمت بیستم و دوم:
انتخاب استاد راهنما
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 21 - Initial data analysis ( تحلیل اولیه داده)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
فصل سوم
قسمت بیستم و یکم:
تحلیل اولیه داده ها
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 20 - A Good Poster Presentation (راهنمای تهیه و ارائه یک پوستر)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
فصل سوم
قسمت بیستم:
راهنمای تهیه و ارائه یک پوستر
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 19 - Effective presentation slides (راهنمای تهیه اسلاید های یک ارائه موفق)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
فصل سوم
قسمت نوزدهم:
راهنمای تهیه اسلاید های یک ارائه موفق
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 18 - Reading a scientific paper (یک مقاله علمی را چگونه بخوانیم)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
فصل سوم
قسمت هجدهم:
یک مقاله علمی را چگونه بخوانیم
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است. مهمان این اپیزود:
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 17 - A Bioinformatics Journal Club (یک ژورنال کلاب بیوانفورماتیکی)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
فصل سوم
قسمت هفدهم:
یک ژورنال کلاب بیوانفورماتیکی
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 16 - Network Biology (زیست شناسی شبکه ای)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
فصل دوم
قسمت شانزدهم:
زیست شناسی شبکه ای
تصویر تزئینی مقاله یا تلاشی برای رفع یک نیاز؟
سخنرانی در یازدهمین همایش بیوانفورماتیک ایران
برای دسترسی مستقیم به اسلایدهای سخنرانی کلیک کنید
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 15 - To be a bioscientist (چگونه پژوهشگر -زیستی- شویم؟)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
فصل دوم
قسمت پانزدهم:
چگونه پژوهشگر -زیستی- شویم؟
این اپیزود محتوای صوتی برنامه لایو اینستاگرام به میزبانی مجموعه اتحاد زیست شناسان ایران است که در تاریخ ۲۴ آذر ۱۴۰۰ صورت گرفته است.
(پیشاپیش از برخی از نویز های ناشی از کیفیت اینترنت و غیرقابل ادیت عذرخواهی می کنم)
در مدت این برنامه در مورد مباحث زیر صحبت شد و پاسخ ها بر مبنای تجربیات شخصی من به عنوان یک پژوهشگر در حوزه علوم زیستی است:
- مهارت های مورد نیاز پژوهشگر
- نکاتی در بررسی ارزش انواع مقالات
- چگونه ارتباط گرفتن با اساتید به منظور مشارکت در طرح های پژوهشی
- تفاوت پژوهشگر بودن در ایران و خارج از ایران
مهمان این اپیزود:
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 14 - Ten Colourful Rules (ده قانون رنگی)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
فصل دوم
قسمت چهاردهم:
ده قانون رنگی
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
شکل اول این مقاله در نسخه اولیه یه اشتباه لپی داشته که نسخه تصحیح شده شکل از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 13 - From Virgool to Genome Biol. (از ویرگول تا ژنوم بیول)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
فصل دوم
قسمت سیزدهم:
از ویرگول تا ژنوم بیول
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
مهمان این اپیزود:
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 12 - Ten common statistical mistakes, ten commandments (ده اشتباه رایج آماری، ده فرمان)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
فصل دوم
قسمت دوازدهم:
ده اشتباه رایج آماری، ده فرمان
مقاله اصلی این اپیزود از طریق این لینک در دسترس است.
همچنین در حین صحبت به چهار مقاله دیگر نیز اشاره شد:
مقاله اول با استفاده از مفهوم «خلاف واقع» سعی کرده تشخیص بیماری رو تسهیل کنه.
مقاله دوم یکی از مقاله های دکترای همایون افرابندپی هست که توش سعی شده با مدل کردن احتمالاتی یک شخص متخصص و استفاده از دانش پایه، تشخیص دارو برای یک سری بیماری خاص رو دقیق تر کنیم.
مقاله سوم روش جدیدی (البته در سال 2013!) برای انجام تست معنی داری بر اساس متدهای بیزی ارائه داده که در شرایط مختلف با روش تی تست هم مقایسه کرده و نتیجه گیری این بوده که در حالت کلی متد مبتنی بر بیزی نتیجه گیری بهتری ارائه می ده.
مقاله چهارم هم مربوط میشه به پیشنهاد جدید برای دسترسی بهتر خوانندگان به دیتای استفاده شده در رسم اشکال در مقالات.
به دیتاست های
هم اشاره شده که در ویکیپدیا می تونید بیشتر در موردش بخونید.
مهمانان این اپیزود:
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 11 - Get to function, not just expression (به عمل کار برآید، به بیان ژن نیست)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
فصل دوم
قسمت یازدهم:
به عمل کار برآید، به بیان ژن نیست
با بررسی مقاله ای در مورد بیان ژن ها در زیست شناسی که به صورت سخنرانی در نهمین همایش بیوانفورماتیک ایران ارائه شد
برای دسترسی مستقیم به مقاله و اسلایدهای سخنرانی کلیک کنید
همچنین در سخنرانی به یه مقاله قدیمی مربوط به بیماری هاری اشاره شده که از این لینک می تونید ببینید
مهمان این اپیزود:
#از_R_لذت_ببریم:
این دفعه نداریم
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 10 - Clear Crystal (کریستال شفاف)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
قسمت دهم:
کریستال شفاف
با بررسی مقاله ای در مورد تصحیح پی ولیو
برای دسترسی مستقیم به مقاله یا خلاصه آن در سایت ویرگول کلیک کنید.
مهمان این اپیزود:
#از_R_لذت_ببریم:
برای جزییات بیشتر این بخش این مقاله ویرگول کلیک کنید.
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 9 - A Solution for Levinthal's Paradox (پاسخی برای پارادوکس لوینتال)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
قسمت نهم:
پاسخی برای پارادوکس لوینتال
با بررسی چند مقاله از مهدی میرزایی
برای دسترسی مستقیم به مقاله ی اول، دوم، سوم، چهارم و پنجم کلیک کنید.
مهمانان این اپیزود:
#از_R_لذت_ببریم:
نکاتی برای رسم نمودارهای زیباتر
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
t.me/jafarilab
@jafarilab
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 8 - Traditional medicine as a dataset (پزشکی سنتی به منزله یک مجموعه داده)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
قسمت هشتم: پزشکی سنتی به منزله یک مجموعه داده
(با بررسی چند مقاله از خودم و همکاران)
لینک مقاله اول:
t.ly/qJHI
لینک مقاله دوم:
t.ly/6VaR
مهمانان این اپیزود:
روجا رحیمی
آرمان زرگران
#از_R_لذت_ببریم:
فرمت تاریخ در آر
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
t.me/jafarilab
@jafarilab
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 7 - COVID-19 and Radio repairing (کروناویروس و تعمیر رادیو)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
قسمت هفتم: کروناویروس و تعمیر رادیو
(با بررسی مقاله ای از یوری لِیزِبنیک در مجله کنسر سل)
مهمان این اپیزود:
محمدرضا صادقی
#از_R_لذت_ببریم:
قواعد نامگذاری در آر
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
t.me/jafarilab
@jafarilab
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 6 - A tale of a computational mistake (داستان یک اشتباه محاسباتی)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
قسمت ششم:
داستان یک اشتباه محاسباتی
(با بررسی سه مقاله از جین دِسِتی و عظیم شریف در مجله کارنت بیولوژی)
مهمان این اپیزود:
امیرمحمد گمینی
#از_R_لذت_ببریم:
چرا برای علم داده، آر بهتر از پایتون است؟
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
t.me/jafarilab
@jafarilab
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 5 - Twelve Rules for Science (دوازده قانون برای ساینس)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
قسمت پنجم:
دوازده قانون برای ساینس
همراه با
#از_R_لذت_ببریم
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
t.me/jafarilab
@jafarilab
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 4 - Promises, promises, and precision medicine (هر وعده که دادند به ما باد هوا بود؟)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
قسمت چهارم:
هر وعده که دادند به ما باد هوا بود؟
(پزشکی دقیق)
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
t.me/jafarilab
@jafarilab
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 3 - Interactive and exploratory learning (با هم یاد بگیریم، با هم کشف کنیم)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
قسمت سوم:
با هم یاد بگیریم، با هم کشف کنیم
(زیست شناسی سرطان)
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
t.me/jafarilab
@jafarilab
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 2 - Pvalue
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
قسمت دوم:
پی ولیو کمتر از پنج صدم! لطفا خداحافظ
برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی یا توییتر پادکست در تماس باشید
t.me/jafarilab
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 1 - For Ph.D. students (برای دانشجویان دکتری)
به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید قسمت اول: آنچه دوست دارم دانشجویان دکتری از دوره دکتری بدانند؟ برای ارسال نظرات میتوانید از طریق ادمین کانال تلگرامی در تماس باشید، t.me/jafarilab
Did you enjoy exploring my podcast?
Episode 0 - Introduction (مقدمه)
Episode 0 - Introduction Telegram: @jafarilab به پادکستی برای زیست شناسی محاسباتی و ترویج علم خوش آمدید
Did you enjoy exploring my podcast?